Виноградное семя принадлежит к типу анатропных семян. В зрелом состоянии оно имеет грушевидную форму с удлиненным клювиком, в котором находится зародыш, и выемкой с противоположной стороны.
Виноградные семена различных видов и сортов значительно отличаются по форме. В пределах сорта форма и средний вес семени является наиболее постоянным ампелографическим признаком.
Семена Vitis vinifera отличаются от семян других видов рода Vitis довольно длинным клювиком, который достигает одной трети длины семени, и расположением халазы в верхней трети спинной стороны семени. У семян других видов клювик в большинстве случаев короче и халаза занимает середину спинрой стороны семени.
Брюшная и спинная стороны семени различны. Брюшная поверхность обращена внутрь ягоды и имеет две продольные выемки, между которыми расположен шнуровидный выступ — семенной шов.
Последний начинается в клювике семени, у пыльцевхода, проходит по дну бороздки через всю брюшную сторону продольно и заканчивается на спинной стороне кольцеобразной вдавленной розеткой, называемой халазой.
Спинная сторона, выпуклая в верхней части, в нижней принимает более плоскую форму и на конце переходит в клювик, заканчивающийся рубчиком.
Длина семени у V. vinifera варьирует в среднем от 3 до 8,5 мм ширина — от 3 до 5 мм. В 1 г содержится в среднем 17—69 воздушно-сухих виноградных семян.
Физиологическая зрелость семян наступает в период полного созревания ягод, к этому времени семена приобретают характерные для сорта форму, окраску и размер. Клювик созревает несколько позже.
Окраска зрелых семян у различных сортов V. vinifera различна и варьирует обычно между светло-коричневой с желтым оттенком и темно-коричневой. Клювик и халаза также отличаются у разных сортов по окраске, что является хорошим ампелографическим признаком.